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Título : Detección de virus respiratorios de la familia Coronaviridae en quirópteros urbanos de las provincias de Loja y Zamora Chinchipe
Autor : Armijos Rivera, Jorge Isaac
Parra Rivadeneira, Gabriela Steffania
Palabras clave : CORONAVIRUS
TRANSMISION INVERSA
MURCIELAGOS
Fecha de publicación : 15-abr-2024
Editorial : Loja
Resumen : Los coronavirus son una familia de virus que pueden causar enfermedades altamente patógenas y zoonóticas tanto en animales como en humanos. Uno de los miembros más conocidos de esta familia es el Coronavirus tipo 2 (SARS-CoV-2), virus responsable de la pandemia de COVID- 19 que ha tenido impacto global sin precedentes. Los murciélagos son reconocidos como reservorios naturales de los coronavirus, lo que significa que estos animales pueden albergar y transmitir el virus de forma asintomática. Dada la capacidad de los coronavirus para mutar y evolucionar, es esencial llevar a cabo una vigilancia continua de la presencia y evolución del SARS-CoV-2 en poblaciones de murciélagos, ya que esto puede proporcionar información valiosa para la prevención de futuras pandemias y la protección de la salud pública. En Ecuador, existen escasos estudios relacionados a la aproximación de los reservorios naturales del SARS- CoV-2, ante esta situación, se estableció un estudio de carácter observacional y transversal, enfocado en identificar la presencia de SARS-CoV-2 y otros coronavirus en murciélagos. Siendo así, se capturó un total de 126 murciélagos como muestreo no probalístico (por conveniencia) provenientes de las provincias de Loja y Zamora Chinchipe. En esta investigación, hemos integrado enfoques moleculares como la técnica RT-qPCR (Reacción en cadena de la polimerasa cuantitativa). Los resultados revelaron una frecuencia de infección por SARS-CoV-2 del 13,49 % en 4 especies distintas (Desmodus rotundus, Anoura geoffroyi, Carollia perspicillata, Carollia sp). Además, identificamos la presencia de otros coronavirus (CoV) en el 24,60 % de las muestras, con los virus (HCoV-NL63, HCoV-HKU1, HCoV-229E, HCoV-OC43). Finalmente, empleamos la técnica de secuenciación de genoma completo (ILLUMINA), evidenciando similitudes que varían entre el 57 % y el 78 % entre los genomas analizados y la secuencia de referencia para SARS-CoV-2 en humanos (NC_045512.2). La detección de similitudes genómicas entre los genomas analizados y la secuencia de referencia para SARS-CoV-2 en humanos destaca la importancia de comprender la diversidad viral en poblaciones de murciélagos, lo que puede tener implicaciones para la vigilancia epidemiológica y la comprensión de la posible transmisión zoonótica de coronavirus.
Descripción : Coronaviruses are a family of viruses that can cause highly pathogenic and zoonotic diseases in both animals and humans. One of the best-known members of this family is Coronavirus type 2 (SARS-CoV-2), the virus responsible for the COVID-19 pandemic that has had unprecedented global impact. Bats are recognized as natural reservoirs of coronaviruses, which means that these animals can harbor and transmit the virus asymptomatically. Given the ability of coronaviruses to mutate and evolve, it is essential to conduct ongoing surveillance of the presence and evolution of SARS-CoV-2 in bat populations, as this may provide valuable information for the prevention of future pandemics and the protection of public health. In Ecuador, there are few studies related to the approximation of the natural reservoirs of SARS- CoV-2. In view of this situation, an observational and cross-sectional study was established, focused on identifying the presence of SARS-CoV-2 and other coronaviruses in bats. Thus, a total of 126 bats were captured as a non-probabilistic sampling (by convenience) from the provinces of Loja and Zamora Chinchipe. In this research, we integrated molecular approaches such as the RT-qPCR technique (Quantitative Polymerase Chain Reaction). The results revealed an infection frequency of 13.49 % with SARS-CoV-2 across four different species (Desmodus rotundus, Anoura geoffroyi, Carollia perspicillata, Carollia sp). Additionally, we identified the presence of other coronaviruses (CoV) in 24.60 % of the samples, including viruses (HCoV-NL63, HCoV-HKU1, HCoV-229E, HCoV-OC43). Finally, we employed the full genome sequencing technique (ILLUMINA), revealing similarities ranging between 57 % and 78 % among the analyzed genomes and the reference sequence for SARS-CoV-2 in humans (NC_045512.2). The detection of genomic similarities between the analyzed genomes and the reference sequence for SARS-CoV-2 in humans underscores the importance of understanding viral diversity in bat populations, which may have implications for epidemiological surveillance and the understanding of potential zoonotic transmission of coronaviruses.
URI : https://dspace.unl.edu.ec/jspui/handle/123456789/29569
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