Caracterización morfo-cultural e identificación molecular de comunidades bacterianas de la cuenca hidrográfica El Carmen- Loja

Abstract

Las microcuencas son ecosistemas de gran importancia ambiental por su gran diversidad biológica, paisajística, cultural y prioritariamente por su capacidad de almacenar el líquido de la vida: el agua. Hoy día se redoblan esfuerzos para encaminar estudios que contribuyan al conocimiento de las comunidades biológicas que habitan estos tipos de ecosistemas. Es por ello que la presente investigación tuvo como objetivos caracterizar y comparar comunidades bacterianas en muestras de agua y sedimentos de la microcuenca “El Carmen” del Cantón Loja, fuente abastecedora de agua para la población lojana; teniendo en cuenta variables climatológicas y de vegetación de la zona de estudio en época lluviosa. Este estudio partió de un diagnóstico de varibles ambientales que se encuentran estrechamente relacionadas a la proliferacion de comunidades bacterianas, tales como: temperatura, precipitación y vegetación riparia. Posteriormente se realizó la cuantificacion, caracterización morfo-cultural e identificación molecular de los aislados procedentes de aguas y sedimentos. Los resultados obtenidos ponen de manifiesto que no hubo una marcada influencia de las variables ambientales evaluadas sobre la cuantificación y diversidad de microorganismos analizados. Sin embargo, pudo determinarse que Índice de Calidad de las Riveras (RQI) se catalaogó como “Bueno”, debido a que todos los atributos medidos fueron óptimos. El análisis de la cuantificación de las comunidades bacterianas arrojó que en la mayoría de las muestras existe una tendencia a la estandarización de la curva de crecimiento en los periodos evaluados, con excepción de ESP2 B y ESP3 B para agua y ESP1 B para sedimentos. La comparación entre ambas quebradas respecto a las UFC ml-1 en las muestras de agua, demostró que en la quebrada Espumos existe un 7.7% de incremento con respecto al quebrada El Carmen; mientras que para sedimento la quebrada El Carmen superó a Espumos en 31.1% de UFC g-1 bacterianas. Mediante la caracterización morfocultural se pudo determinar que la apariencia más abudante entre las comunidades bacterianas fue barbada, la forma circular, elevación convexa y plana o aplastada, borde entero continuo, color beige y tinción de Gram cocos Gram positivos y bacilos cortos gram negativos. Todas estas características se corresponden con las pertenecientes a los géneros Bacillus y Micrococcus. Los métodos moleculares permitieron la extracción de ADN genómico y la amplificación del gen 16S rRNA para la identificación a nivel de especies de las bacterias aisladas; sin embargo, esta actividad no pudo realizarse a cabalidad debido a que no pudo realizarse la secuenciación genómica.