Estudio de la variabilidad genética de la guanta cuniculus paca en el Ecuador

Abstract

Cuniculus paca L. conocida como guanta, es el segundo roedor más grande del mundo, posee un tamaño que puede alcanzar los 80 cm de largo. La cabeza es abultada y el arco de las mejillas es pronunciado, las orejas son relativamente pequeñas y los ojos son grandes y salientes, apropiados para la actividad nocturna. Pertenece a la familia Cuniculidae exclusiva de la región Neotropical y en Ecuador Ceron (1995) señala a esta especie en la región noroccidental y estribaciones orientales de la costa; en la sierra en las estribaciones orientales y en la región oriental del país. El objetivo de este trabajo de investigación ha sido determinar el grado de variación genética existente en guanta en el Ecuador, ya que la importancia del nivel de conocimiento de la genética de una especie dada, radica en que la variabilidad genética refleja su probabilidad de adaptación y persistencia, como requisito indispensable para su propia conservación. Se colectaron muestras de diferentes tipos de tejidos de dieciséis individuos en diferentes lugares de todo el país, se estandarizaron los protocolos de extracción de ADN, siendo el método Chelex® 100 propuesto por Walsh et al (1991) en tejido sanguíneo el que mejores resultados dio, respecto a calidad y cantidad de ADN, sobre el método TES y cloroformo alcohol isoamílico en tejido muscular. En general con ambos protocolos con sus respectivas modificaciones, se obtuvo un ADN con la calidad suficiente para amplificar con éxito los marcadores moleculares AFLPs seleccionados. Dos combinaciones de marcadores AFLPs (E-AAG/M-CAC, E-ACG/MCTA) se emplearon en el análisis de la variación genética en esta especie. En total 265 marcadores resultaron de la amplificación de dichos pares de iniciadores AFLPs, de los cuales 264 fueron polimórficos (99.69%). Además los valores de heterocigosidad esperada fue de 0.328 que es el valor más alto y 0.174 es el valor más bajo para la combinación uno y dos respectivamente. La información de la estructura genética poblacional que exhiben los dendrogramas, indican la conformación de conglomerados muy heterogéneos, no solo respecto a las distancias genéticas, sino también a las diferencias entre los puntos de muestreo; este mismo caso se observa en los gráficos de análisis de coordenadas principales (ACP). La insuficiente relación entre la agrupación de la mayoría de individuos para formar los cluster (dendrograma) y conglomerados (ACP) con la información geográfica puede ser atribuida al hecho de que las variaciones presentes en cualquier región del ADN son aleatorias, y, debido a que los AFLPs son marcadores que analizan todo el genoma de la especie en estudio (Vos et al, 1995), pueden amplificar fragmentos de ADN que pueden estar presentes en los genomas de individuos de su propia población o en individuos de poblaciones diferentes. En conjunto la información de la variabilidad y estructura genética de Cuniculus paca L. en el Ecuador sugieren la existencia de un alto nivel de diversidad. Así mismo, se realizo el análisis de consenso para lo cual fue necesario que de todos los individuos involucrados se contase con información tanto morfológica como molecular, por tal razón se trabajo únicamente con nueve, obteniéndose un dendrograma que muestra la agrupación de ocho individuos quedando fuera el individuo muestreado en Zurmi, lo que indica que los datos morfológicos están totalmente relacionados con los datos moleculares; respecto al individuo Zurmi resulta evidente que sus caracteres morfológicos y moleculares son particulares lo que provoca su clara separación del grupo o grupos que se forman en los diferentes análisis de coordenadas principales lo que además se confirma en los dendrogramas.